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エキシマレーザーをどのように制御して照射するかという計算式をアルゴリズムと言います。 ビームの特性、レーザービームはエネルギー分布によって、フライングスポットとブロードビームに分類されます。
フライングスポットはさらにガウシアンビームとトランケイテッド・ガウシアンビームに分類されます。 ガウシアンよりも、卜ランケイテッド・ガウシアンの方が均一で滑らか。

フライングスポットブロードビームガウシアンは山なりのエネルギー分布のため、中心ほどエネルギーが高いので、角膜を滑らかに削ろうとすれば、周波数（一秒間に照射するビーム数）を高くして数多くのビームを重ねる必要があります。 ガウシアンを改良したトランケイテッド・ガウシアンは、エネルギー分布の中央部を広く平坦化することでガウシァンよりも角膜を滑らかに削ることができます。
また、単位時間当たりの照射回数を多くせずに、安定したエネルギーによって、より精密な角膜の加工を行います。 ガウシアンは山なりのエネルギー分布であるため、ビームのどの部分で計測するかによって、その直径が異なります。
そのため、ガウシァンのビームサイズは有効ビーム直径で示します。 レーザービームの直径を小さく表示している医療機関がありますが、これはガウシアン曲線の中央値を示したもので、有効ビームサイズを示したものではありません。
直径0.92ｍｍアマリスのビームサイズは0.92ｍｍメートルです。 ビームサイズは小さいほど精密照射できるというわけではありません。
角膜面のレーザー切除によって角膜の曲率が急に変化すると、ハロやグレァなど夜間視力の低下が起こることが知られています。 そのため、瞳孔領域を100％矯正しても、その周辺のセカンドゾーンを広くしなければ夜間視力の低下は防げません。
部位によってビームサイズを変えるという複雑な技術を導入しているのはこのような理由からです。 卜ランケイテッド・ガウシアンの採用だけではなく、部位によってビームサイズを変更することで、より均一で滑らかな角膜面を実現して日中の視力向上だけではなく、夜間視力の向上も達成しています。
一発ごとのビームの角膜切除量が深ければ治療時間は短縮できても精密さに欠け、角膜切除断面が荒くなります。 「周波数が高いので照射時間が短い」という情報がインターネットに書かれていますが、これは誤りです。

同じ矯正度数で、同じオプティカルゾーンを設定した場合、1.25倍の照射時間がかかります。

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